2012年11月1日零點南通農副產品物流中心迎來了水產交易區的正式營業，其建筑面積19000平方米，分為大棚交易區和大廳交易區。大棚區以鮮活淡水魚和海水魚類交易為主，大廳區則以凍品和精品水產交易為主�，F水產區占地面積為14778.41㎡，平均日交易額150多萬、交易量300噸。